美国斯克利普斯研究所Xin Jin研究组利用大规模并行体内Perturb-seq技术，揭示了大脑皮层发育过程中细胞类型特异性转录网络。相关研究近日在线发表于《细胞》。

研究人员利用AAV的多功能向性和标记能力，扩大了体内CRISPR筛选的规模，在胚胎到成人大脑和外周神经系统中进行了单细胞转录组表型分析。通过对AAV血清型中的86种载体结合转座子系统进行广泛测试，研究人员大大提高了标记效果，并将体内基因递送从数周加速到数天。子宫内的原理性验证筛选确定了Foxg1的多效应，强调了它对第六层皮层丘脑神经元细胞命运特化所必需的独特网络的严格调控。

值得注意的是，该平台可以标记大于6%的脑细胞，超过了目前慢病毒标记小于0.1%的最先进效率，从而在一次实验中分析超过3万个细胞，并实现大规模并行体内Perturb-seq。它与各种表型测量（单细胞或空间多组学）兼容，提供了一种灵活的方法，可用于体内跨细胞类型的基因功能检测，将基因变异转化为因果功能。

来源：科学网-中国科学报

作者：小柯